（1）兩類標準所含體系要素的數(shù)量不同：從ISO9001的附錄D可以看出，ISO9004－1 和ISO9001相比，ISO9004-1有21個要素，而ISO9001只有20個要素（ISO9002有19個要素，ISO9003有16個要素，ISO9001對質量保證的要求、費用也，ISO9002次之、費用中等，ISO9003要求、費用也）。與ISO9001相比，ISO9004-1增加了“質量經濟性”、“產品”和“營銷”，沒有“合同評審”和“顧客提供產品的控制”這兩個要素。
（2）兩類標準相同要素的內涵不同： ISO9004-1作為一個指導企業(yè)建立質量體系的標準規(guī)定了要達到要素的要求可以采取的途徑或措施，這些途徑和措施指導企業(yè)建立和實施質量體系，企業(yè)可根據自身的具體情況對此加以選擇和采用；而ISO9001質量保證標準是用于外部質量保證的目的，是證實、評定供方質量體系的有效性的標準。因此，它只規(guī)定質量體系要素的要求，而不規(guī)定達到要素要求所采取的途徑，更不規(guī)定實施要素的具體方法。只要能用客觀證據證實要素能夠達到要求就可以了。
（3）適用情況不同：ISO9004－1是用于質量管理指南，標準的主題內容闡述了質量體系一般應包含的基本要素；而ISO9001質量保證標準是用于合同情況、第二方認定和第三方認證或注冊，標準的主題內容是圍繞外部質量保證活動，從需方的要求出發(fā)，規(guī)定需方對供方的質量體系要求。
（4）約束程度不同：ISO9004－1作為組織建立質量體系的指導性標準，標準本身對組織不構成約束；而ISO9001提供了典型的合同要求，一旦簽署了合同或取得認證，標準中所有規(guī)定的要求就是強制執(zhí)行的條款，合同雙方都必須遵守執(zhí)行。
（5）質量管理標準和質量保證標準審核不同：①審核目的不同；②委托方、受審核方和審核方不同；③審核員的注冊不同；④審核計劃不同；⑤審核內容的多少不同；⑤對糾正措施的態(tài)度不同。
